نوسانات درآمدهای نفتی، هزینهکرد این درآمدها برای مصارف جاری بدون توجه به عدالت بین نسلی، ناکامی سهم نفتی صندوق توسعه ملی در ماموریتهای محوله در جهت توسعه کشور، کمبود منابع مالی برای سرمایهگذاری در صنایع بالادستی بخش نفت و بدهیهای انباشته شرکت ملی نفت ازجمله چالشها و مسائل اصلی در تخصیص درآمدهای نفتی به سه نهاد دولت، صندوق توسعه ملی و شرکت ملی نفت است.