مواضع و سخنان علی شمخانی در طول این سالها تغییرات زیادی داشته است. در واقع، تفکرات و گفتار او طی این سالها صیقلهای زیادی خوردهاند؛ کسی که زمانی به عنوان وزیر دولت سید محمد خاتمی از ردصلاحیتها در انتخابات مجلس هفتم انتقاد میکرد و در زمان فرماندهیاش در سپاه خوزستان نامهای انتقادی درباره سپاه پاسداران مینوشت و حتی حضور در کابینه دولت میرحسین موسوی را افتخار تلقی میکرد؛ اکنون به یکی از مخالفان اصلی برجام تبدیل شده است.