بنای اصلی مسجد در طول ۱۵۰ سالی که از عمر آن میگذرند چند بار مرمت شده، اما خوشبختانه بنای قدیمی آن تغییر چندانی نکرده و جز اضافه شدن چند حجره در طبقه دوم ساختمان مدرسه، همان هویت و ساختار اولیه را حفظ کرده است. با ورود به محوطه مسجد و مدرسه سپهسالار قدیم، جلوخان وسیع آن که از هر سو با دیوارهای طاقنمادار محصور شده، هشتی گنبددار، جلب توجه میکند.