بارزترین و قابل تاملترین ایراد در مجموعه حمل ونقل شهر تهران، نحوه تخصیص منابع به آن وعدم شفافیت در چگونگی هزینه آنهاست. عمدهترین مصرف منابع عمومی مربوط به تامین زیرساخت وعدم دسترسی آسان عموم مردم به شبکه حمل و نقل همگانی است که موجب ناکارآمدی سیستم حمل و نقل در تهران شده است.