گذر از نظام تولید معیشتی به کشاورزی مدرن و توسعهیافته همچنان از مهمترین چالشهای کشاورزی ایران است. بحران آب، خشکسالی و سایه تهدید تغییر کاربری اراضی و همچنین قطعه قطعه و کوچک شدن اراضی کشاورزی حتی حفظ وضع موجود و کشاورزی معیشتی را هم به چالش میکشاند.