دکتر فاطمه طباطبایی طی سخنانی در مراسم رونمایی از کتاب «انوار حکمت» در مؤسسه تنظیم و نشر آثار امام خمینی(س) قم، گفت: امام خمینی(س) به لحاظ مبانی فکری کاملاً با جناب قاضی متفاوت است، چون که امام قائل به اصالت وجود هستند، او قائل به اصالت ماهیت است. امام اشتراک معنوی وجود را قبول دارند، او آن مسأله را قبول ندارد. امام حرکت جوهری صدرایی را میپذیرند و او آن را نمیپذیرد. گرچه در توضیحی که برای مراحل نفس میدهد جناب قاضی، ناخودآگاه حرکت و سیر تدریجی نفس را میپذیرد که اینجا یک تناقضی در آرایش دیده میشود.