امام در ابتدای مبارزه، به دنبال پیشگیری از اقدامات ضد مذهب بود

یکی از انگیزه های امام،مبارزه با صهیونیسم جهانی و عوامل داخلی آنها و صیانت از احکام اسلام و قرآن و حفاظت از استقلال کشور و جلوگیری از نفوذ بیشتر اعضای فرقه ضاله بهائیت در ارکان حکومت بود.