آیت الله سیدمجتبی خامنه‌ای همسر زهرا حداد عادل و پدر ۳ فرزند است؛ محمدباقر، فاطمه و محمدامین

ازدواج سید مجتبی خامنه‌ای همواره با روایت‌های جالبی همراه بوده است. در سال ۱۳۷۸ بود که زندگی شخصی مجتبی خامنه‌ای وارد مرحله جدیدی شد و او با زهرا حداد عادل، دختر غلامعلی حداد عادل، ازدواج کرد.