یکی از چالشهای صنایع کشور وجود برخی آلایندگی ها و به دنبال آن جریمه و یا پرداخت های سنگین عوارض زیست محیطی(یک در صد از فروش) است که خود این صنایع همچون ذوب آهن اصفهان سهمی در بهره گیری از این امکان جهت کمک به اصلاح و یا کاهش آلایندگی ندارند.گرچه تا کنون پروژه ها وهزینه های سنگینی را در این زمینه اجرا نموده اند.