به گزارش رسانهها، محمدمهدی در منزل فوت کرده و علت مرگش ایست قلبی بوده است. به گفته حسن مرادی، از نزدیکان خانواده صدیقی، محمدمهدی صدیقی سابقه بیماری کبدی و قلبی داشته و شب گذشته که در نماز جماعت مسجد ازگل شرکت داشته به یکی از نزدیکانش گفته «از قضایای اخیر دارم دق میکنم و حالم خوب نیست»