حجت الاسلام و المسلمین سید حسن خمینی در پیامی نوشت: خامنهای عزیز بزرگ بود و بزرگ ماند و با مرگی سرخ برای همیشه قهرمان مردم ایران و مسلمانان جهان خواهد بود؛ و امروز ماییم که باید با شناخت صحیح از شرایط و با توجه به مصالح ملی و اسلامی، راه او را که همان راه امام و راه پیامبران و ائمه اطهار(ع) بود بپیماییم.