ملاحظات زیستمحیطی یکی از مهمترین چالشهای طرحهای پیشین ایرانرود بود، اما طراحان آبراه ایران معتقدند در نسخه جدید، با اصلاح مسیر، جلوگیری از عبور از کلانشهرها، کاهش تداخل با جنگلهای هیرکانی و بهرهگیری از فناوریهای ضدنشت و گذرگاههای حیاتوحش، تلاش شده است اثرات منفی زیستمحیطی پروژه به حداقل برسد و ارزیابیهای محیطزیستی در تمام مراحل اجرا مورد توجه قرار گیرد.