در بیست و هشتم آذر ماه سال ۶۶، امام در وصیت نامه مهمی خطاب به فرزندشان سید احمدآقا خمینی نوشتند: تو با آنکه در هیچ شغلی از شغلهای سران اسلامی ـ ایّدهم الله تعالی ـ وارد نیستی، این‌‎ ‎‌سیلی های طاقت فرسا را که می خوری برای آن است که فرزند منی و به حسب فرهنگ‌‎ ‎‌غرب و شرق باید من و هر کس به من نزدیک …

در بخشی از ‏‏وصیت‌نامۀ یادگار امام آمده است: به فرزندان عزیزم حسن و یاسر (رضا) و علی سفارش‌‎ ‎‌می‌کنم که متدین و باتقوی باشند و دوست دارم در حوزه‌‎ ‎‌علمیه قم درس دینی بخوانند و در موقعش متلبس به لباس‌‎ ‎‌روحانیّت شوند. معتقدم اینطور بیشتر محفوظ می‌مانند.