Me 329 از طرح بال پرنده بهره می برد که در زمان خود بسیار پیشرفته به شمار می رفت. خلبان و ناوبر در کنار یکدیگر و زیر یک کابین حبابی بزرگ قرار می گرفتند و برای دفاع از بخش عقب نیز یک مسلسل کنترل از راه دور در دم در نظر گرفته شده بود.