محمود علیزاده طباطبایی، عضو شورای مرکزی حزب کارگزاران، گفته بود که «محمدباقر قالیباف دستور حمله نیروهای امنیتی در کوی دانشگاه را صادر کرده است». بر همین اساس مرتضی طلایی، فرمانده انتظامی تهران بزرگ در سالهای ۱۳۸۰ تا ۱۳۸۵، اظهارات علیزاده را نادرست خواند و گفت: انتظار از یک شخصیت حقوقی این است که دقیق سخن بگوید.