یکی از مهم‌ترین ابهامات پابرجا، نحوه مرگ اپستین در زندان فدرال نیویورک است؛ مرگی که به‌طور رسمی «خودکشی» اعلام شد، اما نقص‌های امنیتی همزمان، از کار افتادن دوربین‌ها و غفلت‌های غیرقابل توجیه، این روایت رسمی را با تردیدهای جدی مواجه کرده است.

یک نشریه انگلیسی نوشت: باوجود تکذیب نقش رئیس‌جمهوری آمریکا در پرونده یک قاچاقچی جنسی، نام وی سه هزار بار در پرونده تکرار شده است.