مقامات و کارشناسان منطقه آسیای مرکزی با اشاره به پیشرفت سریع پروژه کانال قوش‌تپه در شمال افغانستان، نسبت به کاهش شدید منابع آبی در کشور‌های پایین‌دست آن هشدار داده‌اند.

مقامات قزاقستانی هشدار دادند ساخت کانال قوش‌تپه در افغانستان می‌تواند بحران زیست‌محیطی در منطقه ایجاد کند.