آیت‌الله جعفر سبحانی در یادداشتی آورده است: علی(ع) نه بر اثر تصادف تاریخی، بلکه در پرتو وراثتی پاک، تربیتی نبوی و محیطی سرنوشت‌ساز، به شخصیتی یگانه بدل شد. او پرورش‌یافته وحی و ادب نبوت بود؛ انسانی که اگر جامعه زمانه‌اش او را به‌درستی می‌شناخت، مسیر تاریخ اسلام می‌توانست به گونه‌ای دیگر رقم بخورد و …

آیت‌الله جعفر سبحانی از مرجع تقلید در پیامی به آیین نکوداشت استاد محمدعلی مهدوی‌راد، وی را از مصادیق برجسته عالمانی دانست که با تلاش‌های علمی و پژوهشی، مسیر تحقیق و اندیشه را برای جامعه علمی روشن می‌سازند.

آیت‌الله سبحانی مرجع تقلید شیعیان توضیحاتی درباره نظریه «عندالاستطاعة» بودن مهریه بیان کرد.