دوران دبیری او در مرکز ملی فضای مجازی با چالش‌هایی همراه بود؛ از جمله اختلاف نظر با وزارت ارتباطات وقت (محمود واعظی) بر سر حدود اختیارات مرکز ملی فضای مجازی و شورای عالی. بسیاری او را تئوریسین ایزوله کردن هوشمند فضای مجازی در ایران می‌دانند.

اقتصادنیوز: انتظاری به عنوان یکی از اعضای حقیقی شورای عالی فضای مجازی (منصوب شده توسط مقام رهبری) همواره در تدوین سیاست‌های کلان محدودسازی پلتفرم‌های خارجی و هدایت بودجه‌ها به سمت زیرساخت‌های داخلی نقش فعالی داشته است.

محمدحسن انتظاری یکی از اعضای شورای عالی فضای مجازی است که حالا نامش در رسانه ها به عنوان یکی از چهار شاکی به دیوان عدالت اداری درباره فعالیت ستاد فضای مجازی دولت پزشکیان درج شده است. درباره انتظاری و سابقه فعالیت‌اش در شورای عالی فضای مجازی چه می‌دانیم؟

سایت‌های خبری نوشته‌اند «کامیار ثقفی، رضا تقی پور، رسول جلیلی و محمدحسن انتظاری» چهار فردی هستند که «تحت راهبری یک مقام ابقا شده دولت سیزدهم» این اقدام را انجام دادند. هیچ یک از این افراد تا لحظه تنظیم این گزارش، واکنشی به این موضوع نشان ندادند.