یکی از چالش‌های اصلی نظام تأمین اجتماعی، نبود نهاد مستقل و حرفه‌ای برای تنظیم‌گری و نظارت بر صندوق‌هاست. برخلاف حوزه‌های بانکی و بیمه‌ای که دارای رگولاتور مشخص‌اند، بیمه‌های اجتماعی از چنین سازوکاری بی‌بهره‌اند؛ مسئله‌ای که به گفته کارشناسان، موجب ناهماهنگی سیاست‌ها و تداوم مشکلات صندوق‌ها شده است.