بهای تمام شده درآمدهای عملیاتی نیز 26828453 میلیون ریال معادل حدود 2680 میلیارد تومان بوده است.
زیان خالص این شرکت در سال مورد اشاره 1015317 ریال معادل حدود 1000 میلیارد تومان بوده که 233 درصد بیشتر از زیان سال 1402 است.
در بخشی از گزارش سازمان حسابرسی آمده است:
«شرکت بابت حسابهای فیمابین خود با شرکت راه آهن جمهوری اسلامی ایران و ذیحسابی طرحهای عمرانی آن تا پایان سال مورد گزارش بهطور خالص مبلغ 2518 میلیارد ریال طلب (مابهالتفاوت مبلغ 3817 میلیارد ریال طلب منعکس در سرفصل دریافتنیها و مبلغ 1299 میلیارد ریال بدهی منعکس در سرفصل دریافتنیها) در دفاتر منعکس نموده که در مقایسه با مبلغ 18389 میلیارد ریال طلب مورد ادعای آن شرکت در صورت تطبیق حسابهای فیمابین و پاسخ تاییدیه واصله نشانگر مبلغ 20907 میلیارد ریال مغایرت نامساعد است.
مبلغ 10784 میلیارد ریال از این مغایرت مربوط به هزینه تامین نیروی کشش جهت حمل قطارهای مسافری بهدلیل استفاده از نرخهای قرارداد اجاره سال 1399 و عدم امضای قرارداد جدید مبلغ 8818 میلیارد ریال از مغایرت مربوط به مطالبات یارانه جبران زیان قطارهای حومهای و تکلیفی شرکت طی سالهای 1395 تا 1403 است که شواهد و مستندات تایید آن توسط شرکت راه آهن به این سازمان ارائه نشده است.»
