دخالت مراجع و علمای دینی در آزاد کردن رهبر جنبش دینی و اجتماعی ایران از حصر در اواسط سال ۱۳۴۲ اگرچه تاثیری در مدت حصر نداشت، اما موجب همراهی و مشارکت بزرگان حوزه‌های علمیه از جمله آیت‌الله سید محمدهادی میلانی در مبارزه سیاسی علیه رژیم پهلوی شد.

امام خمینی بنیانگذار نظام جمهوری اسلامی بیان کردند: «اگر مرحوم حاج شیخ در حال حاضر بودند، کاری را انجام می‌دادند که من انجام دادم.» و تأسیس حوزه علمیه در آن روز از جهت سیاسی کمتر از تأسیس جمهوری اسلامی در ایرانِ امروز نبود.