داستان جانی پاف: ماموریت مخفی : جانی پاف: ماموریت مخفی یک انیمیشن ماجراجویی است که داستان جانی پاف و دوستانش را دنبال می‌کند. در این فیلم، آن‌ها در یک ماموریت مخفی برای نجات شهر تایگاسویل از نقشه‌های شریرانه اوتو فون والروس شرکت می‌کنند.