جمعه, ۱۴ اردیبهشت, ۱۴۰۳ / 3 May, 2024
مجله ویستا

ارزیابی تنوع ژنتیکی جمعیت های بومی یونجه ایران با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره ESTs


ارزیابی تنوع ژنتیکی جمعیت های بومی یونجه ایران با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره ESTs
به منظور تعیین تنوع ژنتیکی بین برخی توده های بومی یونجه زراعی، شش جمعیت ایرانی بمی، رهنانی، نیک شهری، همدانی (از منطقه اصفهان)، همدانی (از منطقه شیراز)، یزدی و یک جمعیت رنجرآمریکایی با ۲۴ جایگاه ریز ماهواره طراحی شده از مناطق (ESTs) Expressed Sequence Tags گیاه Medicago truncatula و سه جایگاه ریز ماهواره ای شناسایی شده از کتابخانه ژنومی M. sativa ارزیابی شدند. براساس نتایج تکثیر باندهای مورد نظر و میزان چند شکلی، از بین آغازگرهای به کار رفته چهار جایگاه (AW۹, BEE, TC۶, TC۷) EST-SSR و یک جایگاه ریزماهواره ژنومی (AFct۳۲) برای تخمین تنوع ژنتیکی میان جمعیت های یونجه مورد بررسی مناسب تشخیص داده شدند. در مجموع ۴۶ آلل برای این جایگاه ها در میان جمعیت ها از ۰.۶۲ تا ۰.۸۷ برآورد شد. تجزیه و تحلیل روابط ژنتیکی براساس اطلاعات EST-SSR، جمعیت رنجر آمریکایی را به طور کامل از جمعیت های یونجه ایرانی متمایز نمود. بنابراین به نظر می رسد که والدین این یونجه متفاوت از جمعیت های ایرانی باشد. براساس دندروگرام رسم شده، جمعیت های یونجه ایرانی به دو گروه اصلی تقسیم شدند. ارقام سردسیری همدانی و رهنانی در یک گروه و ارقام گرمسیری بمی، یزدی و نیک شهری در گروه دیگر قرار گرفتند. موقعیت مناطق ریز ماهواره ای EST در ناحیه کد شونده ژنوم، احتمالا قابلیت استفاده از این نوع نشانگرها را برای روشن کردن روابط بین جمعیت های یونجه افزایش می دهد.
مسعود بهار
سیروس قبادی
وحید عرفانی مقدم
احد یامچی
مجید طالبی بداف
محمدمهدی کابلی
علی اکبر مختارزاده محمدی
منبع : پایگاه اطلاعات علمی