شناسایی بیفیدوباکتریوم‌های جدا شده از نمونه‌های مدفوعی در ایران با استفاده از PCR با پرایمرهای اختصاصی در سطح جنس و آنالیز توالی ژنی ۱۶SrRNA

در این تحقیق برای اولین بار بیش از ۴۰ ایزوله باکتریایی مربوط به بیفیدوباکتریوم از مدفوع تعدادی از شهروندان ایرانی جدا و خالص سازی شد. پس از مطالعه خواص فنوتیپی و شناسایی آنها در سطح گونه، ۱۸ ایزوله از آنها به عنوان بیفیدوباکتریوم لانگوم، ۱۰ ایزوله به عنوان بیفیدوباکتریوم بیفیدوم و یک ایزوله به عنوان بیفیدوباکتریوم کتنولاتوم شناسایی شدند. اما با استفاده از آزمایشات فنوتیپیک برای بقیه ایزوله ها نظر قاطعی جهت قرارگیری در زیر گونه ای مشخص ارائه نشد. بنابراین برای تایید در سطح جنس و نیز برای شناسایی دقیق گونه های باکتریایی جدا شده به یکی از دو روش، استفاده از PCR با پرایمرهای اختصاصی Bif ۱۶۴f و Bif ۶۰۱r یا تعیین توالی نوکلئوتیدهای ژن ۱۶SrRNA مورد بررسی و مطالعه قرار گرفتند. به کارگیری PCR علاوه بر تایید باکتری هایی که قبلا با استفاده از آزمایشات فنوتیپیک تحت جنس بیفیدوباکتریوم شناسایی شده بودند، مشخص نمود که ۸ ایزوله رد شده با آزمایشات فنوتیپیک نیز متعلق به جنس بیفیدوباکتریوم است. در روش تعیین توالی نوکلئوتیدهای ژن ۱۶SrRNA علی رغم قرارگیری ۵ ایزوله در زیر گونه بیفیدوباکتریوم لانگوم اختلاف قابل توجهی در تخمیر کربوهیدرات های آنها با این گونه مشاهده می شود که ممکن است در تخمیر ۲ تا ۶ کربوهیدرات با آن اختلاف داشته باشند. علاوه بر این تعدادی از ایزوله های تایید شده به عنوان بیفیدوباکتریوم لانگوم قادر به تخمیر ریبوز نبودند. بنابراین با توجه به نتایج حاصل، سویه های جدیدی از بیفیدوباکتریوم لانگوم در این طرح ارائه شده است.

مرتضی خمیری
سیدعلی مرتضوی
حمیدبهادر قدوسی
علی خامسان
درخشان احمد
فخری شهیدی

منبع : پایگاه اطلاعات علمی