ایو باکتری ها یا باکتری های حلالی بدون جدار سلولی

ایو باکتری ها یا باکتری های حلالی بدون جدار سلولی و با جدار سلولی که عوامل بیماریزای محدود درشبکه ی آوندهای عآلی در گیاهان می باشند

ایو باکتری ها یا باکتری های حلالی بدون جدار سلولی و با جدار سلولی که عوامل بیماریزای محدود درشبکه‌ی آوندهای عآلی در گیاهان می‌باشند .

● مقدمه:

میکرواروگانیزم های مورد مطالعه در این تحقیق شامل دو گروه باکتری ها ی حلالی به نام ملیکیوتس که یکی از گروه گونه های پست ، سیتوزین مثبت و گرم مثبت که فاقد دیواره سلولی کلاسیک Mollicutes بوده ودیگری شامل دو باکتری قرمز رنگ بنام پروتیباکتری ها از گروه گونه های گرم منفی می بــاشد . بعضی ازاین ار گانیزم ها به آوندهای عآلی گیاهان حمله کرده و تولید بیماری می نمایند. بنابراین آنها جزء عوامل بیماریزای گیاهی محسوب شده در حالی كه انواع دیگر فقط بر روی بافتهای گیاهی مخصوصاً گلها مشاهده شده و بیماریزا نیستند. از میان باکتریهای بیماریزا بر روی آوندهای عآلی فقط نوع اسپیرپلاسماها قابل کشت می باشند در حالی که نوع فایتوپلاسماها و دو نوع از پرتی یو باکتریها هرگز کشت نشده اند. از زمان اولین گردهمایی مربوط به آلودگی باکتری‌یایی ویا شبكه باكتری در محیطهای کشت بافت در سال ۱۹۸۷ که در آن گردهمایی ملیکیوتس های گیاهی برای اولین بار معرفی شدند تا به حال مطالعات زیادی در خصوص آنها صورت گرفته مخصوصاً در خصوص باكتریهای دارای دیواره سلولی که به آوندهای گیاهان حمله می کنند. پیشرفتهای مربوط‌‌ به رده بندی ، خصوصیات طبقه بندی ، شناسایی و تشخیص این ارگانیزم ها دراین تحقیق بررسی گردیده كه غالب‍‍‍ِأ بخاطر وجود این تکنولوژیهای جدید ویا اصلاح شده درزمینه‌ی بیوشیمی مولکولی ، بیولوژی وژنتیک مخصوصا‌‌ً در رابطه با زنجیره‌های مولكول DNA ریبوزمی S۱۶ و مقایسه الكتروفریسیس به منظور اندازه گیری وآزمایش UGA با كدهای قابل استفاد ه بوده است. آزمایش UGA به منظورمتوقف كردن كدها ویا برای كد تریپتوفان، تعیین كلسترول ۸۰ مورد نیاز ملیكیوتس آزمایش، مربوط به سیستم قند تراسفرز (PTA ) احیا كننده و بالاخره برای احیاء فراگمنت های DNA مخصوص که دارای زنجیره ی احیاء پلی مرز ( (PCR جهت واکنشهای زنجیره ای برای شناسایی خصوصیات عوامل باکتری‌زا وعلل دیگرمورد استفاده قرار گرفته است. اثبات و بررسی مراکز و محل اولیه باکتریهای حلالی ازنوع ملیکیوتس: مقایسه زنــــــجیره های DNA ریبوزمی ۱۶S مربوط به گروه ملیكیوتس ها با باکتریهای دیگر نشان داده است که، ملیکیوتسها دارای یک شبکه‌ی پلی لوژنتیک درخت مانند از نوع باکتریهای حلالی گرم مثبت می باشند . در حال حــاضر ملیکیوتس ها به علت تکامل بعضی ژنها ی خود را ازدست داده واندازه آنها تحلیل رفته است. در صورتی که نژاد اولیه‌ی آنها باکتریهای گرم مثبت بوده که دارای (G+C)كمتری در ژن آنها وجــود داشته است. اقوام نزدیک باکتری‌های حلالی که دارای دیواره‌ی سلولی بسته می‌باشند، شامل دو گونه گرم مثبت با G+C)) كم بنامهای clostridium ramosum و innocuum clostridium می باشند. این نوع کلستریدیاها شبیه ملیکیوتس‌های اولیه بوده که انروپلاسماز واستروپلاسمازآنها هنوز از نــــــوع مخصوص انیربز می باشد که نشان دهنده‌ی انیربیوسز وراثتی موجود در نژادهای اولیه آنها نیزهــــست؛ مقاومت موجود در ملیكیوتس‌ها و همچنین در دو گروه کلستریدیال احتمالا از نژادهای اولیه ‌آنها كه دارای(G+C) كمی در ملكول DNA بوده‌اند به‌ارث رسیده است.

● فایــــــــــلوژنتیک درختی ملیکیوتسها: این درخت پنج گروه فایلوژنتیکی را نشان می دهد

۱) گـــــــروه اسپیروپلاسما شامل دو گو نه جدید mesoplasma وEntomoplasma اما بعضی از انواع به خصوص Mycoplasma مثل M.mycoides نیز مشاهده می‌گردد.

۲) گـــــــروهmycoplasma pneumonias .

۳)گــــــروه mycoplasma hominis))

۴) گروه انیرو پلاسما اكولید پلاسما كه در این گروه فایتو پلاسما خوشه‌ای می باشد.

۵) گروه استرو پلاسما كه فقط دارای یك نوع باكتری می باشد . ملیكیوتس های كه دارای شاخه های فایلوژنتیكی نزدیك به هم با (G+C) كم وگرم مثبت بوده در آنها از دست رفتن دیواره سلولی درهمان اوایل صورت گرفته است. (شكل۲) كه علت آن از دست رفتن ژن (شكل۲ GL ) در طول تكامل بوده است . شاخه شاخه شدن گروه استرولی پلاسما نشان دهنده ی ازدست دادن دیواره‌ی سلولی در مراحل اولیه می‌باشد . احتمالاً این مطلب صحیح نمی‌باشد، زیرا عمل شاخه شاخه شدن در این گروه هنوز صورت نگرفته است؛ در كد ژنتیكی یونیورسال فقط یك كد برای تریپتفان وجود دارد كه عبارتند از ۳ .۵uGG ملیكیوتس‌ها به عنوان ارگانیزم های دارای ( (G+Cكم موفق به ساخت كد جدید تریپتفان با G كمتر بنام ۵UGA شده اند كه در آن ۳A بجای ۳G در UGG قرار گرفته است. این مطلب به صورت Trp =UGA نشان داده شده است. برای انجام این جابجایی آنها یك مولكول RNA جدید را با آنتی كد ۵VCA۳ كه قابلیت ترجمه UGA و UGG را دارد بوجود آورده‌اند. ((۴ را ببینید )) بنابراین در تكامل اخیر ملیكیوتس‌ها مثل اسپیروپلاسما، انتموپلاسما، مزوپلاسما، مایكوپلاسما و یوریوپلاسما ژن UGA به عنوان كد تریپتوفان مورد استفاده قرار گرفته است در حالی كه در ملیكیوتس‌های اولیه‌ی مثل انیرپلاسما، استروپلاسما، اكولی پلاسما، فایتوپلاسما ژن UGA به عنوان كد متوقف كننده مورد استفاده قرار گرفته است؛ هر چند كشت فایتوپلاسما امكان پذیر نمی باشد اما گفته می شود كه شاخه‌های آنها به اكلی‌پلاسما شباهت داشته وآنها ملیكوتس‌های حقیقی می‌باشند.

● رده بندی ملیكیوتس‌ها تا حد گونه : تعریف گونه های ملیكیوتس ها بر اساس خصوصیات مختلفی مثل انیریوسیز، هلیكال مرفولوژی، احتیاجات كلسترول ویا توین ۸۰، ‌‌‌‌ درجه حرارت مناسب رشد وهیدرولیز اوره صورت می گیرد. اندازه‌ی ژنوم به عنوان یك خصوصیت مهم در تعریف گونه مد نظر قرار گرفته است با بوجود آوردن الكتروفرسیس ضربانی(PFGE ) كه یك تكنولوژی دقیقتر وبهتری نسبت به روش اولیه احیا جنبشی می‌باشد نشان داده شده است كه در میان گونه‌های زیاد اندازه‌ی ژنوم بسیار متفاوت می‌باشد؛ نیاز كلسترول برای مدت زیادی به عنوان یك عامل اصلی در تشكیل رده بندی در بین ملیكیوتس‌ها اهمیت داشت. اما كشفیات جدید این موضوع را در طبقه بندی ملیكیوتس‌ها كم اهمیت كرده‌است. گونه‌های زیادی از باكتری‌های حلقوی (اسپیروپلاسما ) مثل S.apils S.floricola S.chinense S.diabroticae بدون حضور كلسترول نیز رشد ونمو كرده‌اند این نشان دهنده‌ی این مطلب است كه خانواده‌ی اسپیروپلاسماتسی از نظر ژنتیكی به دو شاخه تقسیم شده اند ویك گونه جدید بنام هلیكوپلاسما كه شبیه Mollicutes حلالی بوده وبرای رشد احتیاجی به استرول ندارد نیز بوجود آمده است؛ همچنین ممكن است نیاز كلسترول به عنوان یك عامل مهم در طبقه بندی Mollicutes كاملاً از بین رفته باشد.

باالاخره خانواده‌ی انتمپلاسماتالیس كه شامل گونه های انتمپلاسما ، مزوپلاسما و اسپایروپلاسما می‌باشد، براساس محل زندگی رده بندی شده است . در حقیقت بیشترین میزبان این خانواده حشرات می باشند و عامل انتقال دهنده‌ی آنها زنجیره‌هایی می باشند كه بر روی برگ گیاهان زندگی می كنند.

روشهای تشخیص مولكول در خصوص مایكوپلاسمولوژی و مطالعات آنها اخیراً قابل دسترس می باشد. باكتریهای دارای دیواره‌ی سلولی عامل بیماری در سلول آوندی لیبروباكتری وفلوموباكتری (پرنی یو باكتری ها ) Candidatus phlomobacter fragariae نامگذاری گردید.

● پروتی باكتریهایی از نوع (گاما) به سه زیرگروه مهم تقسیم می شوند

۱) باكتری های فتوسنتز كننده ازنوع سولتور قرمز مثل chroatiun

۲) گونه هایی كه با بیماریهای لكه‌ای همراه هستند.مثل Legionella

۳) مخلوطی از انواع غیرفتوسنتز كننده مثل Endosymloiontsو pseudomonadsو Escherichia coli كه به مورچه ها حمله میكنند. Buchaera كه به شته و مگس تسه تسه ومگس سفید و زنجره حمله می‌كند كه گونهBacter phlomo در همین زیر گروه كه بیشترین انگلهای باكتری حشرات در آن موجود می باشند یافت میگردد . بر اساس خاصیت توالی در مولكول DNA ریبوزمی ۱۶S موجود در باكتریBacter phlomo در گیاه توت فرنگی یك نوع pcr جدید بوجود آمده است ؛كه برای اولین بار شناخت عامل بیماری توت فرنگی را در گیاهان آلوده امكان پذیر مینماید. بدون شك برای شناخت حشره ناقل بیماری نیز مناسب می باشد. به طور خلاصه هرچند كه كه عوامل زنده ومیكروارگانیزم های موجود درسلول های آوندی معمولاً همراه با بیماری سبز مركبات و زردی لبه ی برگهای توت فرنگی می باشند، كشت آنها در محیط آزمایشگاهی امكان پذیرنیست. اما از طریق بدست آوردن مولكول های DNA ریبوزمی ۱۶S روش pcr متوالی ومقایسه آنها با DNA ریبوزمی۱۶S موجودات دیگرمی توان آنها را شناسایی كرد. این تحقیق نشان می دهد كه شبه باكتریهای اولیه ، شبه باكتری های حقیقی هستند كه دقیقاً به آنها پرتو باكتری گفته می‌شود. لیبروباكتری های سبز دارای یك زنجیره در زیر مجمموعه مربوط به پرتوباكتری‌ها می‌باشند اما باكتریphlombacter در توت فرنگی یك زنجیره جدیدی است كه مربوط به پرتوباكتری نوع گاما( ) می باشد. هر دو زیر مجموعه آلفا و گاما دارای باكتری هایی می باشند كه به حشرات نیز حمله می كند. بنابراین انتقال لیبرو باكتری بوسیله حشرات یك امر معمولی بوده و عامل انتقال باكتریplomobacter نیزمربوط به گروهای شبه باكتری eubacteria نیزمی باشد.عوامل بیماری محدود در سلول آوندی باكتری‌های بدون جدار ،اسپیروپلاسما و فایتوپلاسماست، برعكس شبه باكتری ها (eubacteria ) كه در گذشته مورد بحث قرار گرفتند، اسپیروپلاسماها وازنوع Mollicutes بوده كه فاقد دیواره سلولی می دهد.

اسپیروپلاسماها حلالی شكل بوده ودر محیط كشت قابل كشت می‌باشد. اما فایتوپلاسماها حلالی شكل نبوده و هر گز قابل كشت نمی‌باشند. اسپیروپلاسماها شامل گروهای فائلوژنتیك با كد UGA مربوط به تریپتوفان بوده اما فایتوپلاسماها جزئی از گروه اكولی پلاسما بوده كه كدUGA آنها متوقف كننده می باشد. همچنین خصوصیات فایتوپاتوژنتیكی یا بیماریزائی در اسپیروپلاسما وهمه فایتوپلاسماها درمحلهای یكسان در گیاهان یافت می‌شود. این محلها معمولاً سلولهای آوندی مَشبك در بافتهای آوندی می‌باشد. اسپیروپلاسماها و فایتوپلاسماها دارای دو میزبان یعنی گیاهی و حشره مخصوصاً زنجره ها هستند.

عبداله کرمی

مطالعه وتحقیق توسط آقایان جی ام بوهو منیک گارنیر ازکشورفرانسه

---